防水電連接器的密封材料直接決定防水效果與使用壽命，選擇時需結合使用環境、溫度范圍及介質特性綜合考量。常用的基礎密封材料為硅橡膠，其具備優異的耐高低溫性能（-55℃至200℃）、良好的彈性與耐老化性，適配多數常規戶外、工業潮濕環境，且對多種化學介質穩定性強，是通用場景的首要選擇。若應用于高溫、油污環境，如汽車發動機艙、工業油污車間，通常選用氟橡膠，其耐溫可達250℃，且耐油性、耐腐蝕性遠超硅橡膠，但彈性略遜于硅橡膠，成本相對較高。

 對于低溫環境（如極地、冷鏈設備），則可選用三元乙丙橡膠，其在-40℃仍能保持良好彈性，且耐候性、耐臭氧性突出。此外，密封材料的硬度也需匹配，一般選用邵氏硬度50-70度的材料，既能保證插合時的壓縮量，又能避免過度硬化導致密封失效，確保不同環境下密封結構的可靠性。